La maggiore Associazione di aikido è naturalmente quella voluta e fondata dallo stesso Morihei Ueshiba, che ha il nome di Zaidan Hojin Aikikai (Fondazione Culturale Aikikai) ed ha sede a Tokyo.
A partire dagli anni 60 del secolo scorso diversi hombu dojo shihan sono stati inviati in altrettanti paesi dell'occidente per diffondervi l'arte dell'aikido, fondando a loro volta altre associazioni nazionali che hanno anche esse il nome di Aikikai.
Col passare del tempo anche altre scuole sono nate e si sono affermate, anche se la tendenza a medio termine sembra piuttosto quella di volersi riunire sotto l'ombrello della casa madre.